Ученые впервые построили виртуальную модель внешней оболочки вируса гриппа

В Оксфордском университете при помощи крупномасштабного молекулярно-динамического моделирования впервые в мире сумели построить полную виртуальную модель внешней оболочки вируса гриппа А (к нему относится птичий и свиной грипп). Это поможет ученым понять, как вирус выживает в природе, чтобы найти новый способ борьбы с ним.

Британские ученые начали компьютерное моделирование внешней оболочки вируса гриппа с 73-нанометрового шара с неплотно упакованными липидами. Потом этот шар за 300 наносекунд уменьшили до 59 нанометров. После этого к липидным молекулам добавили вирус-специфические белки и раствор. Так получилась модель особой частицы с липидопротеиновой оболочкой, в которую вне организма превращается вирус гриппа (такую частицу еще называют варионом).

Вирус-специфические белки, образующие мембрану этой особой частицы, распределены по ней равномерно. Это усиливает взаимодействие между гриппом А и клетками-хозяевами.

«Если промежутки между вирус-специфическими белками совпадают с Y-образными бивалентными антителами, то их можно применять в терапевтическом дизайне», - считает Тайлер Редди, один из авторов этого исследования.

Редди и его команда ученых начали работать над созданием полной виртуальной модели внешней оболочки вируса гриппа А еще в 2010 году, после того, как он познакомился с Дэниелем Партоном, который первым начал работу в этом направлении. Сейчас Партон является научным сотрудником Мемориального онкологического центра Слоун-Кеттеринга (США).

Партон в 2010 году работал над молекулярным моделированием белка, имеющим отношение к ахондроплазии (наследственное заболевание, из-за которого у человека очень маленький рост). Редди был впечатлен его работой, и сам задумал создать виртуальную модель внешней оболочки вируса гриппа.

Ученые также отмечают, что гликолипид Форссмана предотвращает белки от скопления и уменьшает их диффузию. Поэтому в своих следующих моделированиях оболочки вируса гриппа они планируют включить и гликолипиды.

Виртуальная модель внешней оболочки вируса гриппа дает представление о времени жизни вариона в различных средах, например, в пресноводной реке. Напомним, что пресноводные реки являются средой обитания водоплавающих птиц, которые переносят грипп А.

Пока ученым еще не удалось узнать как функционирует внешняя оболочка вируса гриппа в длительном периоде. Тем не менее, они надеются создать виртуальную модель, которая покажет динамику, по крайней мере, за один год. Это позволит многое узнать о мутациях гриппа.